两性聚丙烯酰胺的结构是以丙烯酰胺单体为主要结构单元，通常在丙烯酰胺单元之间插入其他带有电荷基团的单体单元，或是在丙烯酰胺单元上的酰胺基团上接入其他结构，或是通过改性反应将酰胺改变为电荷基团。
根据聚合物分子中正负电荷基团的分布，两性聚电解质一般可分为两大类：随机性两性聚电解质与甜菜碱型两性聚电解质，结构示意见图1。
随机性两性聚电解质是指正负电荷基团分别在不同的单体上，而正负电荷单体位于同一单体上的聚合物则称为甜菜碱型两性聚合物。
根据分子链上正负电荷基团数量是否相等可分为对称性两性聚电解质和非对称性两性聚电解质，正负电荷基团数量相等为对称型，反之则为非对称型。
此外，根据单体单元在溶液中电离性质还可将两性聚合物分为强酸弱碱型、强碱弱酸型、强酸强碱型和弱酸弱碱型；
根据单体单元序列可分为随机型、交替型、镶嵌型和接枝型。
针对不同的应用领域、应用环境和应用目的，选择使用的两性聚丙烯酰胺类型不同。目前，在造纸工业中两性聚丙烯酰胺研究和使用较多的是非对称随机型。
